Il dr. Danese si laurea in Medicina e Chirurgia nel 1999 presso l'Università Cattolica del S. Cuore - Policlinico Gemelli di Roma. Dal 2001 al 2004 è Research Associate presso “Division of Gastroenterology - Case Western Reserve University, Cleveland, USA” dove si occupa di malattie infiammatorie croniche intestinali sotto la guida del Prof. C. Fiocchi. Nel 2004 diventa specialista in Gastroenterologia presso la Scuola di Specializzazione del Policlinico Gemelli di Roma, diretta dal Prof. G. Gasbarrini, e inizia presso l'Università Cattolica del S. Cuore il dottorato di Ricerca in Fisiopatologia del Metabolismo occupandosi specificamente di ricerca di base e applicata sulle malattie infiammatorie croniche intestinali. L'attività clinica e di ricerca del dott. Danese si è rivolta principalmente allo studio dei meccanismi patogenetici delle malattie infiammatorie croniche intestinali, e ai meccanismi d'azione dell'impiego di nuovi farmaci biologici nella terapia del morbo di Crohn e della rettocolite ulcerosa.

Il dr. Danese ha ricevuto importanti finanziamenti per le sue ricerche da prestigiose organizzazioni americane come la Crohn's and Colitis Foundation of America e la Broad Medical Foundation. Nel 2006 ha ricevuto finanziamenti dalla Comunità Europea per lo studio delle mutazioni genetiche in pazienti affetti da malattie infiammatorie croniche intestinali mediante tecnologia di “IBDchip”.

Il laboratorio di ricerca del dr. Danese ha ricevuto finanziamenti dal Ministero Italiano della Salute per il progetto “under 40”, da AIRC e da Fondazione Cariplo.

Il dr. Danese coordina il Centro di Ricerca per le malattie infiammatorie croniche intestinali presso Humanitas ed è impegnato in progetti di ricerca di base e studi clinici sull'uso di nuovi farmaci in pazienti affetti da malattie infiammatorie croniche intestinali, in collaborazione con numerosi centri italiani, europei e statunitensi.

E' membro di varie società scientifiche nazionali ed internazionali di Gastroenterologia ed Endoscopia Digestiva, ed è attivamente impegnato nell'AGGEI - Associazione giovani gastroenterologi ed endoscopisti italiani (dal 2006), dove svolge l'incarico di Consigliere. Dal 2007 è membro del Comitato Scientifico della ECCO (European Crohn's and Colitis Organization). Dal 2011 è membro dell'International organization of inflammatory bowel disease (IOIBD). Ha pubblicato oltre 70 articoli su riviste ad alto impact factor.